期刊简介

  本刊是由浙江预防医学会主办,系综合性预防医学学术类科技期刊。具有信息量大、出版周期快、导向性强、注重指导性、实用性和可操作性等特点,主要报道本省预防医学各学科的科研成果、实践经验、新技术、新方法以及国内外的最近科技信息,旨在促进我省预防医学事业的发展,为提高全省人民健康服务。本刊稿源丰富,均来自卫生防病的和预防保健、医学教育、科研工作第一线的专业人员。本刊面向基层,以广大预防保健工作者为主要对象。

            

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  • 杂志名称:预防医学杂志
  • 主管单位:浙江省科学技术协会
  • 主办单位:浙江省预防医学会
  • 国际刊号:1007-0931
  • 国内刊号:33-1400/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:2012年荣获“2011—2012年度中华预防医学会系列杂志优秀期刊三等奖”期刊收录:上海图书馆馆藏, 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 知网收录(中), 国家图书馆馆藏, 万方收录(中), 维普收录(中)
预防医学杂志2017年第11期

基于GEO芯片数据库的结肠癌易感基因挖掘

钟要红;何青芳;李迎君;丁烨;景方圆;范春红

关键词:结肠癌, 基因芯片, 差异表达基因, 生物信息学
摘要:目的 筛选结肠癌的关键基因,探索结肠癌发病机制.方法 从公共基因芯片数据库(GEO)搜索有关结肠癌表达的数据,利用GEO2R筛选表达差异基因,对差异基因进行Gene Ontology(GO)富集分析、 信号通路富集分析和蛋白相互作用网络构建.结果 共纳入7套结肠癌基因芯片数据,选出在≥4个数据集中有交集的差异表达基因324个,其中上调基因61个,下调基因263个.324个差异表达基因GO富集分析发现胆汁分泌、 药物代谢-细胞色素P450、 化学致癌作用等与结肠癌的发病有关.筛选得到骨形态发生蛋白2(BMP2)、CXC趋化因子配体1(CXCL1)、CXCL12、CXCL2、 胰高血糖素(GCG)、 白细胞介素8(IL8)、 基质金属蛋白酶1(MMP1)、蛋白磷酸酶2(PHLPP2)和酪酪肽(PYY)9个与结肠癌相关的基因.结论 利用生物信息学方法能有效筛选目标基因,并可为进一步研究提供依据.